Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r58G3X9U3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r58G3X9U3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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