Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nccrp1G3X9C2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms