Protein–RNA interactions for Protein: G3UW78

Cyp4f17, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 17, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f17G3UW78 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f17G3UW78 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp4f17G3UW78 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms