Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubap1lG3UW59 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ubap1lG3UW59 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms