Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r76F8VQ63 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r76F8VQ63 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms