Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ercc6F8VPZ5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc6F8VPZ5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms