Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colca2F8VPY8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colca2F8VPY8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms