Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp9yF8VPU6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp9yF8VPU6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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