Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8444F6XS56 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms