Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm340F6RGI3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm340F6RGI3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm340F6RGI3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm340F6RGI3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm340F6RGI3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm340F6RGI3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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