Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmod3E9QA62 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms