Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Urb2E9Q7L1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms