Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip11E9Q512 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip11E9Q512 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms