Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ApobE9Q414 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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