Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms