Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3250E9Q1M3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms