Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt78E9Q0F0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms