Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx60E9PZQ1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms