Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brd1E9PZ26 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd1E9PZ26 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms