Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph10bE9PYQ0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms