Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r177E9PXM3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms