Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms