Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc175E9PVB3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc175E9PVB3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms