Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clca3bE9PUL3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms