Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Soga1E1U8D0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms