Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms