Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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