Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm5478D3Z6R0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm5478D3Z6R0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm5478D3Z6R0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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