Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms