Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim12cD3Z3L3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms