Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Ccdc6D3YZP9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc6D3YZP9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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