Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3259D3YUK0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3259D3YUK0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms