Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms