Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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