Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatipB9EKE5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatipB9EKE5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms