Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mterf1bB9EJ57 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms