Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Phf11bB4XVQ1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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