Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Abcc8B2RUS7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Abcc8B2RUS7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms