Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apba1B2RUJ5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apba1B2RUJ5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms