Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PtprbB2RU80 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PtprbB2RU80 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtprbB2RU80 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtprbB2RU80 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtprbB2RU80 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PtprbB2RU80 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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