Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zscan5bB2RTN3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms