Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms