Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms