Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms