Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H60cB1B213 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H60cB1B213 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H60cB1B213 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H60cB1B213 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms