Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud3B1AZ99 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms