Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms