Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf25B1AWN9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms