Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trabd2bB1ATG9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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