Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms